Chifty,
хочу научиться как правильно
Надо в цикле собрать запрос(или данные для запроса) а сам запрос делать после выхода из цикла. Опримизировать внутри цикла не вижу смысла, что так, что эдак таблица блокируется.
$string = 'Не обязательно чере IN делать, можешь LIKE использовать.';
$arr = explode(' ', $string);
if (count($arr)) {
$res = $db->query('SELECT * FROM `download__files` WHERE `name` IN("'. join('","', $arr) . '")')->fetchAll();
}